La struttura dell'ufficio può essere schematizzata come segue.
AREA AMMINISTRATIVA
Segreteria del Procuratore della Repubblica
Segreteria Amministrativa e del personale
Ufficio liquidazione spese di giustizia
Casellario
AREA PENALE
Ufficio ricezione atti ed iscrizioni
Segreterie dei Magistrati
Ufficio dibattimento
Ufficio esecuzioni penali
AREA CIVILE
Ufficio Affari civili